Představte si, že realita je jen iluzí a vaše noční můry jsou ve skutečnosti pravda. Představte si, že vaše současnost je minulostí a to budoucí se děje teď. Když si to dokážete představit, potom se budete cítit jako hrdina snímku Matrix Thomas Anderson (K. Reeves). Nebude to příjemný pocit. Anderson je mladý muž, který se jen snaží přežít ve shonu moderního města. Má všechny předpoklady, aby se mu to povedlo: přátele, rodinu a perspektivní práci v multinárodní počítačové firměi Meta Cortech. Jedné noci se však do jeho klidného mozku zakousne strašlivá noční můra. Zdá se mu, že byl proti své vůli vložen v podobě dat do počítače a všechno to, co až dosud považoval za svůj osud, je jen vírem dat okolo několika tištěných spojů. Má pocit, že mu byla mysl ukradena, uvězněna v obřím Matrix počítače budoucnosti. Pochybuje o své každodenní skutečnosti. Byl skutečně vhozen do stroje? Je tam s ním zavřeno i pár stovek lidí, které zná? Co se stane, až jeho věznitelé přijdou na to, že zná pravdu?